CImplicitWeightedSpecFeatures类参考

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详细描述

Features that compute the Weighted Spectrum Kernel feature space explicitly.

参见:

CWeightedCommWordStringKernel

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第29行定义。

继承图，类CImplicitWeightedSpecFeatures

[图例]

所有成员的列表。

公有成员
	CImplicitWeightedSpecFeatures (CStringFeatures< uint16_t > *str, bool normalize=true)
	CImplicitWeightedSpecFeatures (const CImplicitWeightedSpecFeatures &orig)
virtual	~CImplicitWeightedSpecFeatures ()
virtual CFeatures *	duplicate () const
virtual int32_t	get_dim_feature_space ()
virtual float64_t	dot (int32_t vec_idx1, int32_t vec_idx2)
virtual float64_t	dense_dot (int32_t vec_idx1, const float64_t *vec2, int32_t vec2_len)
virtual void	add_to_dense_vec (float64_t alpha, int32_t vec_idx1, float64_t *vec2, int32_t vec2_len, bool abs_val=false)
virtual int32_t	get_nnz_features_for_vector (int32_t num)
virtual EFeatureType	get_feature_type ()
virtual EFeatureClass	get_feature_class ()
virtual int32_t	get_num_vectors ()
virtual int32_t	get_size ()
bool	set_wd_weights ()
bool	set_weights (float64_t *w, int32_t d)
virtual const char *	get_name () const
保护成员
void	compute_normalization_const ()
保护属性
CStringFeatures< uint16_t > *	strings
float64_t *	normalization_factors
int32_t	num_strings
int32_t	alphabet_size
int32_t	degree
int32_t	spec_size
float64_t *	spec_weights

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构造及析构函数文档

CImplicitWeightedSpecFeatures	(	CStringFeatures< uint16_t > *	str,
		bool	normalize = true
	)

constructor

参数:

	str	stringfeatures (of words)
	normalize	whether to use sqrtdiag normalization

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第16行定义。

CImplicitWeightedSpecFeatures

(

const CImplicitWeightedSpecFeatures &

orig

)

copy constructor

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第78行定义。

~CImplicitWeightedSpecFeatures

(

)

[virtual]

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第86行定义。

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成员函数文档

void add_to_dense_vec	(	float64_t	alpha,
		int32_t	vec_idx1,
		float64_t *	vec2,
		int32_t	vec2_len,
		bool	abs_val = false
	)			[virtual]

add vector 1 multiplied with alpha to dense vector2

参数:

	alpha	scalar alpha
	vec_idx1	index of first vector
	vec2	pointer to real valued vector
	vec2_len	length of real valued vector
	abs_val	if true add the absolute value

实现了CDotFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第190行定义。

void compute_normalization_const

(

)

[protected]

compute the sqrt diag normalization constant per string

参见:

CSqrtDiagKernelNormalization

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第35行定义。

float64_t dense_dot	(	int32_t	vec_idx1,
		const float64_t *	vec2,
		int32_t	vec2_len
	)			[virtual]

compute dot product between vector1 and a dense vector

参数:

	vec_idx1	index of first vector
	vec2	pointer to real valued vector
	vec2_len	length of real valued vector

实现了CDotFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第151行定义。

float64_t dot	(	int32_t	vec_idx1,
		int32_t	vec_idx2
	)			[virtual]

compute dot product between vector1 and vector2, appointed by their indices

参数:

	vec_idx1	index of first vector
	vec_idx2	index of second vector

实现了CDotFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第93行定义。

CFeatures * duplicate

(

)

const [virtual]

duplicate feature object

返回:

feature object

实现了CFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第222行定义。

virtual int32_t get_dim_feature_space

(

)

[virtual]

obtain the dimensionality of the feature space

(not mix this up with the dimensionality of the input space, usually obtained via get_num_features())

返回:

dimensionality

实现了CDotFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第58行定义。

virtual EFeatureClass get_feature_class

(

)

[virtual]

get feature class

返回:

feature class

实现了CFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第113行定义。

virtual EFeatureType get_feature_type

(

)

[virtual]

get feature type

返回:

templated feature type

实现了CFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第104行定义。

virtual const char* get_name

(

)

const [virtual]

返回:

object name

实现了CSGObject。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第151行定义。

virtual int32_t get_nnz_features_for_vector

(

int32_t

num

)

[virtual]

get number of non-zero features in vector

参数:

num

which vector

返回:

number of non-zero features in vector

实现了CDotFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第94行定义。

virtual int32_t get_num_vectors

(

)

[virtual]

get number of strings

返回:

number of strings

实现了CFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第122行定义。

virtual int32_t get_size

(

)

[virtual]

get size of one element

返回:

size of one element

实现了CFeatures。

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第131行定义。

bool set_wd_weights

(

)

set weighted degree weights

返回:

if setting was successful

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第46行定义。

bool set_weights	(	float64_t *	w,
		int32_t	d
	)

set custom weights (swig compatible)

参数:

	w	weights
	d	degree (must match number of weights)

返回:

if setting was successful

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp第67行定义。

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成员数据文档

int32_t alphabet_size [protected]

size of alphabet

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第169行定义。

int32_t degree [protected]

degree

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第172行定义。

float64_t* normalization_factors [protected]

use sqrtdiag normalization

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第165行定义。

int32_t num_strings [protected]

number of strings

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第167行定义。

int32_t spec_size [protected]

size of k-mer spectrum

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第174行定义。

float64_t* spec_weights [protected]

weights for each of the subkernels of degree 1...d

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第177行定义。

CStringFeatures<uint16_t>* strings [protected]

reference to strings

在文件ImplicitWeightedSpecFeatures.h第162行定义。

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该类的文档由以下文件生成：

• ImplicitWeightedSpecFeatures.h
• ImplicitWeightedSpecFeatures.cpp